物种分布随气候的变化:BIOMOD使用指南

BIOMOD是R软件的一个程序包,是BIOdiversity MODelling的缩写,主要用来模型物种分布区及其随气候的变化。该软件是Wilfried Thuiller等三位学者在法国蒙彼利埃CNRS功能与进化生态学中心开发的。W. Thuiller是活跃在学术一线的年轻科学家,其发表的学术论文具有较大影响。

BIOMOD程序包可以运行以下模型,对物种潜在分布区进行估算,同时也能够对相应的气候变化的情形下,物种分布区的变化给出预测。预测过程中可以设置物种迁移速率,从而更接近真实结果。

  • Generalised Linear Models (GLM)
  • Generalised Additive Models (GAM)
  • Classication Tree Analysis (CTA)
  • Articial Neural Networks (ANN)
  • Surface Range Envelope (SRE)
  • Generalised Boosting Model (GBM)
  • Breiman and Cutler’s random forest for classication and regression (randomForest)
  • Mixture Discriminant Analysis (MDA)
  • Multiple Adaptive Regression Splines (MARS)

希望本文档对刚刚开始使用BIOMOD的程序包的人员有所帮助。

由于译者水平有限,在翻译过程中难免有不妥的地方,还请读者及时批评指正, 若有疑问可发邮件至jinlongzhang01@gmail.com

译 者

2010年1月

于北京 香山