Windows下安装文件的制作为软件的安装和卸载提供了方便。用户不再用担心可执行文件及动态连接库等保存在固定的文件夹中，只需要进行软件的安装和卸载，就可以将全部需要的可执行文件，以及程序运行所需要的文件创建和删除。这为程序管理提供了很大的方便。安装文件的制作有很多软件，如setup factory, Install shield wizard等等，但是对于小型软件，
Inno setup，这样的小型安装文件制作工具就已经足够了。
Inno setup开始于1997年，是完全免费的，从稳定上和兼容性上，甚至超过了一些商业软件。
这里介绍一下如何用Inno setup创建一个setup文件。以FigTree为例。
FigTree是爱丁堡大学的Andrew Rambaut编写的绘制进化树的软件，用Java写成，可以在多种平台上运行。但是Andrew提供的Windows下的程序包实际上是一个包含exe文件和动态连接库的文件夹，使用起来不是特别方便，因此用Inno
Setup建立一个Windows安装文件，便于对程序的管理和使用。
FigTree可以在 http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/ 下载。下载Windows下的zip程序包，解压缩。
下载Inno setup http://www.jrsoftware.org/isinfo.php 并安装。
创建一个新的Project，按照界面给出的提示，Inno setup会自动生成一个脚本。编译该脚本，即可生成所需的exe文件。一般来说，首先要指定exe文件。其次要给出程序所要包含的文件夹，该文件夹中包含运行该exe所需的动态连接库等。
还有就是创建ico文件，ico文件是Windows的图标，如果现有jpg或者png等其他格式的文件。可以在 http://iconverticons.com/转换成ico文件，作为该setup显示的图形。
了解以上信息，相信读者都能够编译出自己的Windows setup文件了。