BES 是英国生态学会， British Ecological Society的缩写。 英国生态学会开办了 Journal of Applied Ecology, Methods in Ecology and Evolution, Functional Ecology, Journal of Animal Ecology, Journal of Ecology 以及Ecology and Evolution等刊物，这些杂志可以说都是生态学的主流刊物，对论文撰写的要求很高。为了让年轻生态学家和研究生能尽快开展研究并顺利发表研究结果 ，BES在官方网站（ https://www.britishecologicalsociety.org ）在公布了几个小册子， 包括（1）论文撰写和发表；（2）同行评议；（3）数据管理；（4）可重复性研究等，都是PDF文件，供免费下载和浏览。 其中 A Guide to Getting Published in Ecology and Evolution《生态学与进化学论文发表指南》分册有中文版。这四本小册子的网址是： https://www.britishecologicalsociety.org/publications/guides-to/ 。
以下是个人读书笔记， 是根据英文版直接翻译的，并未参考中文译文，因此一些段落未必准确。 如果要了解更多， 请参考这些小册子中的原文。
为什么发表？
传播自己的研究
职业生涯的需要
为科学添砖加瓦
虽然目前发表研究结果有很多渠道，但学术论文仍然是最重要的渠道。
是否可以开始写了？
发表之前要弄清楚自己的论文要传递什么信息？必须要彻底理解自己的研究以及想要交流的信息是什么。开始写之前，要先问问自己，该研究：
是否新颖及有意思？
是否对研究热点有贡献？
是否为难题提供了新的解决方法？
如果对三个问题都是“是”，就有了很好的基础。
编辑Natalie Cooper，论文需要讲一个完整的故事，一般按照如下顺序：
背景知识
基于背景引出问题
给出相应理论做出的假设
清楚给出检验的方法
结果
讨论相应的结果，揭示更深层次的意义
在动笔之前，要考虑好文章要写给谁看，然后再选择杂志。确保内容和格式都符合刊物的要求。一篇论文从头到尾，就说一件事，要说深入、说完整。
拟定题目
先拟一个题目，题目要使用陈述句：
只用大约15个词，太长和太短都会增加拒稿的风险
使用副标题做进一步解释，用冒号隔开
题目要有广泛意义，标题尽量不要含有物种名
可以使用趣味性与双关性的标题，这能够增加论文在网络上传播的机会。不要用疑问句，疑问句会大大减少论文被引用的次数。
不要用缩写，减少术语。
不要使用 The effect of/ the involvement of 等词组。
摘要的撰写
摘要应该在写完论文，也就是讲完故事以后再写。
应该清楚表述了本研究的贡献以及有趣的信息
列出方法和结果
将研究放在大的图景中
指出本研究的贡献以及对本领域的启示
摘要的最后一句是最关键的信息。
Journal of Applied Ecology的投稿指南列出如下要求：
Summary：论文的目的、结果、结论以及相应的建议。各条目要用清楚、忠于事实的陈述句，同时加以编号。
1. 研究背景以及必要性
2. 使用什么方法研究
3. 下面2-3个点，介绍主要结果
4. 最后一点，要给出一般性的建议或者给出对管理上以及政策上的建议。
5. 最后的summary要给出论文的主旨，具有一般性的意义，特别让非专业人员能够读懂。而且必须以以下一种标题结束：
（1）Synthesis and applications：主要适用于在管理上有相关建议的论文
（2）Policy implications：主要适用于讨论研究结果在保育方面的意义以及与政策制定有关系的论文。
写作风格
三个要点：清晰、简洁、准确，即 clarity , simplicity, accuracy
学术写作并不是堆砌术语，优秀的科研论文总是能优雅地展示自己 “Good science speaks for itself!”
Think like a reader and keep it simple.
– Ken Thompson, University of Shelffield, UK. Senior Editor, Functional Ecology
论文中，每多出的一个词汇都会审稿人否定的机会。论文中叙述的点越多，审稿人的批评也就会越多。
使用主动语态，简单直接，避免模糊表达。资深编辑会评价论文中所提出的问题是否值得深入研究，所以一定要阐述清楚研究的紧迫性和重要性，并讲清楚原因。每一小节，都以要表述的重要信息开头，以表述的重要消息以及下一步的引申含义结尾。很多杂志喜欢这样的写作风格，因为这样能把研究放在更广的背景中。
写草稿
先写出草稿，修改草稿时，要确保全文的顺畅，确保要传达的信息清楚，全文紧扣主题。写论文时要一直想着读者。要想想如果是第一次听说这个研究的人会怎样看待这篇论文。由于经年累月进行数据收集、数据分析，写论文时很容易陷入细节，在写作时更重要的，是要阐述清楚研究的背景，并且向读者展示，结论是怎样基于逻辑一步一步得出来的。
材料与方法
撰写材料与方法不能像烹饪指南一样罗列内容，结果部分也不能堆砌统计结果和P值。在材料与方法一段中，要给出分析的具体目的，如为了探讨XXX，我们分析了……。这样，材料与方法还有结果部分，就更容易与其他部分融合成一个整体。
写作的艺术
用陈述句
先陈述，后解释。但是不过度增加细节。细节部分应该尽量用图表展示。
Sophie Evison: 无论在论文中还是在回复审稿意见时，都不能过度解释想法或者数据。因为这些小辫子很容易让人抓住，容易受到批评。
Joseph Bennet：论文不要试图掩盖主要的缺陷或不足。如果研究的不足指出没有说清楚，审稿人可能会在此抓住这一点不放。讨论一节应该正视不足，并指出未来的研究方向。
Alice Hughes: 没有充足证据时，不要做假设，也不要找捷径，会有人注意到的！
Daniel Stouffer: 如果稿件有一段都是对论文的某个缺陷进行辩护，就不要投稿。相反，论文要将研究放入文献支撑的大背景中，找出研究对下一步有什么启示等。研究的可能缺陷要勇敢面对，不能掩盖。审稿人总是能发现研究中存在的疏漏。因为字数限制，将研究结果写成论文相当于穿上了小一号的鞋子，此时再给人发一支枪打自己并不好玩儿……
关键词与搜索引擎
选择紧扣主题的关键词，特别要注意研究的专有关键词。在摘要中，需要适当重复使用关键词，以保证论文能在网站的搜索结果中出现在较为靠前的位置（SEO Search Engine Optimisation）。通常情况下，最好列出15-20个关键词，要尽量使用常用名如水 water,避免使用H2O。选出5个最为核心的关键词以及一些次要关键词。将核心关键词置于题目、摘要、小节标题中，将次级关键词放入正文、图表的标题中。摘要以及正文中，关键词的重复要自然。这样，搜索引擎会更容易找到论文的关键词。
统计
如果不是精通统计，要及早请教行家，以免出现致命错误。
数据存储
一些刊物会要求将数据公开，保存在一些数据存储网站。相关指南可以参考英国生态学会数据管理指南 （https://www.britishecologicalsociety.org/wp-content/uploads/2017/06/BES-Data-Guide-2017_web.pdf）
参考文献
要找到好用的文献管理工具，并尽量使用新版本，如Zotero, Mendeley, Endnote, Reference Manager 等等，这些工具能大大简化文献的管理。论文要尽量引用新的文献，以保证自己对学科进展有较好的理解。
图表
一图胜过万语千言。图表需要精心设计，以体现论文要传递的主要信息。对图表的要求是，即使不看正文，也能明白其中要传递的信息，所以必须要清晰、简单。问自己： 别人在作报告时，会考虑本研究的截图吗？
版权
使用别人的数据、材料、图片，是否经过授权？使用Google Earth的地图截图或者使用网络上的线图，插入自己的论文中是万万不能做的。
检查和编辑
写完初稿后一星期，再重新编辑论文。
拼写和语法：如果不是英语母语人士，应该找一个英语母语的编辑，最好是该领域的专业人士；或者请编辑公司润色。
所有的陈述（statements）以及相应的假设都需要有充足的解释。
去掉多余的词汇或短语，要简约，尽量不要出现术语以避免冲淡信息。
缩写：第一次出现时必须给出全称。
致谢：项目的资助方是否已经都列出来了？对论文有贡献的人，是否都已经感谢了？有些人的贡献可能只适合列在共同作者中，要参考杂志的相应规定。
关键词：关键词要一致，最好能在文中较为均匀地出现。
假说与验证：要保证前言中的假说，在讨论中全部都讨论过了。
Michael Hochberg:
投稿之前，必须要保证稿子经过认真修改和润色。无数的愚蠢错误很可能会惹恼审稿人。那些人知道你是谁，但是你不知道他们是谁。事关个人声誉，后果难以预料。