这是2010年1月，本人在研究组所做的报告之一，内容为依据DNA序列构建进化树的原理与方法，并依据进化树进行分子钟估算。
包括：
- 在GenBank上下载DNA序列
- 在ClustalX中进行DNA序列比对，及其注意事项
- DNA 碱基替换模型及其筛选，ModelTest软件的原理
- 进化树的构建的原理
介绍了距离法，极大似然法，最大简约法和贝叶斯法的原理，及其实现软件PAUP*, PHYLIP, MrBayes - 进化树分枝节点的可信度评估，即Bootstrap方法的原理和实现
- 分子钟假设检验及NPRS平滑方法在r8s软件中的实现。
共有幻灯片101张。
现整理出来，供对进化分析有兴趣的老师和同学参考。
如果有任何问题或建议，欢迎随时与本人联系，
下载 报告幻灯片 从DNA序列到分化时间——进化树与分子钟 .pdf (1.0M)